Paris, trois ans après la catastrophe qui a vu les hommes âgés de plus de treize ans disparaître brusquement, décimés par une mystérieuse grippe. Wolfgang, un garçon d’une douzaine d’années qui a toujours souffert de se sentir mal aimé et d’être la risée de ses camarades, est sauvé par deux enfants, Nolan et Héloïse.
Ceux-ci acceptent de l’héberger dans leur repère secret, aménagé au-dessus d’un supermarché.
Deux années passent, au cours desquelles les enfants grandissent et apprennent à occuper ces longues journées de vacances forcées. Mais leur cachette est envahie par les rats, qui ont proliféré et obligent désormais les survivants à se déplacer sur les toits des immeubles.
Les trois orphelins découvrent alors que le monde violent et brutal qu’ils avaient fui s’est peu à peu organisé, et que la rive gauche de Paris est dominée par un mystérieux groupe d’archers, dont ils vont devoir percer les secrets…